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当缺乏沉水植物时，浮游动物的种群密度处于较低水平(<1 ind/L)，而浮游植物的密度则处于较高水平(38 mm3/L)；当沉水植物的PVI>15%~20%时，浮游甲壳类动物生物量处于较高水平，且体型较大的个体居多 。由此可见，沉水植物群落在一定程度上可保证浮游动物的种群数量，实现对浮游植物的控制，有利于维持湖泊的清水状态。

沉水植物的生态效应机理

不同营养级的上行效应(Bottom-up Effect)和下行效应(Top-down Effect)相结合维持着生态系统群落结构的稳定。沉水植物对无机环境的影响以及与其他生物之间的相互作用(图1)保证了生态系统中上行效应和下行效应及其他级联效应的正常发挥 。

有的研究认为菹草的适宜生长温度为10℃-20℃:陈洪达研究发现水温与菹草净产氧量呈曲线相关，水温为16℃左右，菹草净产氧量高，21℃时毛产氧量高。研究也表明水温为10℃-35℃时，菹草顶枝光合作用净产氧量、毛产氧量都与温度呈曲线相关，20℃附近菹草光合作用产氧量高，适宜的生长温度为15 ℃ -25 ℃。作者认为不同的结论和各人所使用的材料差异有关。 温度对沉水植物光合作用有显著的影响。在不同的沉水植物中已发现与温度有关的光合速率存在着很大差异。

任何一个生态因子如温度、光照，在数量或质量上不足或过多，即接近或达到某种生物的耐受性限度时会使该生物退或不能生存。***有分布的沉水植物即表现为较宽的生态幅（广盐性、广温性、广光性等），比如穗状狐尾藻（Myriophyllum spicatum L.）既可生长在淡水中，也可生长在盐度小于10‰的咸水中。这些植物但尽管能适应较宽生态幅，却能主动从形态、生理、行为等方面对自身进行调整。比如轮叶黑藻（Hydrilla verticillata），每年进入11月份，长江中下游及以北地区慢慢凋亡，从新芽停止生长到老叶脱落到根茎的腐烂，周期持续约1个月，当然也有少量可以保持很绿没有腐烂的情况。